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HANA ASC - 當兩部改編作品都取材自同一原作時，比較在所難免，粉絲們會擁護其中一個版本而排斥另一個，無法迴避各自論點背後的事實。 《鋼之鍊金術師》就陷入了這場爭論，在2003年的《鋼之鍊金術師》和2009年的《鋼之鍊金術師FA》之間搖擺不定。
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兩部作品都講述了艾爾利克兄弟尋找賢者之石的旅程，但一旦故事超越了共同的開篇，它們的基調、節奏和結構就截然不同。 《鋼之鍊金術師》十多年來一直穩居動漫排行榜榜首，常被視為不可撼動的經典之作，但如今的觀眾如果第一次觀看2003年的動畫版，可能會感到困惑，因為他們無疑會驚訝於這部動畫實際上存在諸多缺陷。
2003年的動畫版講述的是與漫畫完全不同的故事。
《鋼之鍊金術師》動畫於2003年首播，當時荒川弘的漫畫仍在連載初期，每月更新，與動畫同步播出。由於時間上的滯後，骨頭社不得不迅速超越原作，並在荒川弘的許可下，在動畫追上未完結的漫畫進度後，創作了原創劇情、反派角色和結局。
大約一半的動畫內容與原作完全不同，講述了艾爾利克兄弟的遭遇、人物和後續發展。現代觀眾往往更傾向於忠於原作的改編作品，而一部動畫在播出中途偏離原作設定，會讓許多觀眾望而卻步。這無疑為希望欣賞荒川弘原著故事的新觀眾設置了一道障礙。
2003版動畫採用了更黑暗、節奏更為緩慢的風格。
《鋼之鍊金術師》動畫版摒棄了大規模的動作場面，轉而採用更為緩慢的節奏，更加註重劇情的刻畫，這與漫畫原作有所不同。動畫將煉金術描繪成一種悲劇性的力量，將帶來真實的心理代價。
愛德華和阿爾馮斯長時間與懷疑和內疚作鬥爭，他們早期的關係，包括與馬斯·休斯和妮娜·塔克的相處，在悲劇發生之前都得到了更充分的展現。這反過來又營造出比《鋼之鍊金術師FA》更沉重憂鬱的氛圍。
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在這種處理方式下，有些角色變得更加陰暗，例如「斬首者」巴里就以一種更加沉重的方式登場，失去了《鋼之鍊金術師FA》中的喜劇色彩。第五研究所的故事線也逐漸走向更陰鬱恐怖的高潮，而「懶惰」則以更黑暗的形像出現，圍繞著人造人統治展開。這種緩慢的內心獨白風格可能會讓期待《鋼之鍊金術師FA》快節奏和更精彩劇情的觀眾感到不適。
